Футбольный клуб «Динамо» был образован на базе одноимённой спортивной базы спортивного общества в 1923 году. До 1936 команды выступала в первенстве Москвы, став семикратным чемпионом в этом турнире. А в 1936 году впервые был разыгран чемпионат СССР, и «Динамо» стало первым обладателем звания чемпиона страны. На следующий год команда повторила свой успех в национальном первенстве и оформила «золотой дубль», взяв помимо золотых медалей чемпионата ещё и Кубок страны.
В 1940 году команда вновь становится чемпионом, а в 1945, опять заняв первое место в чемпионате страны, «Динамо» получает право сыграть на международной арене и едет в турне в Великобританию, где выступает очень удачно. Среди соперников бело-голубых были такие команды как
«Кардифф Сити»,
«Арсенал»,
«Челси»,
«Глазго Рейнджерс».
Пятидесятые годы принесли команде много побед и наград, «Динамо» становится чемпионом в 1949, 1954, 1955, 1957, 1959 годах, а в 1953 второй раз в своей истории берёт Кубок страны.
Однако за этим в команде наметился кризис и за последующие три десятилетия «Динамо» выиграло чемпионат страны дважды — в 1963 и 1976 годах, и четыре раза стало обладателем Кубка страны — в 1967, 1970, 1977 и 1984 годах.
В 1972 году «Динамо» становится первой из советских команд , которая дошла до финала Кубка обладателей кубков, но в решающем матче проиграла в Барселоне «ГлазкоРейнджерс» со счётом 2:3.
В девяностые годы «Динамо» три раза завоёвывает бронзовые медили чемпионата России (1992, 1993 и 1997 гг.), в 1994 команда завершила чемпионат на 2-м месте, а в 1995 «Динамо» стало обладателем Кубка России.
2004 год был не самым удачным для «Динамо». Команда сменила трёх тренеров в течение одного сезона и находилась на грани вылета из высшего дивизиона, однако ей удалось сохранить место среди сильнейших клубов страны. В 2005 году значительно усилился состав команды. Были приобретены такие игроки как
Манише,
Дерлей,
Коштинья и
Сейтаридис. Однако это не помогло «Динамо» занять призовые места и чемпионат команда завершила на 8-м месте.
В 2006 году команду возглавил
Юрий Сёмин, но по ходу чемпионата он был вынужден подать в отставку. Пост главного тренера занял
Андрей Кобелев, которому удалось завоевать вместе с командой бронзу чемпионата страны.
В 2009 году «Динамо» потерпело неудачи на международной арене, проиграв «Селтику» в квалификации Лиги чемпионов и болгарскому ЦСКА в Лиге Европы. В чемпионате страны команда заняла 8-е место.
